张文宏、陈明亮、曾玫联合团队《柳叶刀》子刊最新发文,分析导致2024年中国百日咳大规模暴发的主要原因
来源: 生命科学前沿 2025-07-17


2024年春夏,中国爆发了近年来罕见的大规模百日咳疫情,年发病率达34.03/10万,是2023年的12倍以上,严重打破了既往相对平稳的流行趋势。疫情波及多个省市,主要集中于儿童人群,部分地区成人病例显著上升,提示疫苗保护力下降、病原体变异或监测策略改变等多重因素可能参与其中。因此,迫切需要通过临床与分子流行病学分析,系统评估此次疫情的驱动机制和特征,为未来防控提供科学依据。


2025年7月,复旦大学曾玫团队,联合复旦大学陈明亮团队和张文宏团队,在Lancet子刊在线发表题为“Waning immunity, prevailing non-vaccine type ptxP3 and macrolide-resistant strains in the 2024 pertussis outbreak in China: a multicentre cross-sectional descriptive study”的研究性论文。


研究证明免疫疫苗保护的减弱以及以多抗性MT28克隆为代表的非疫苗型pxtP3菌株的盛行,是导致2024年中国百日咳大规模暴发的主要原因。研究强调当前迫切需要修订国家百日咳疫苗接种策略,以及调整传统的一线抗生素治疗方案。对于4-6岁儿童进行加强免疫接种,已成为控制此次百日咳疫情的紧迫措施。



实验设计与数据收集


本研究在2024年1月1日至9月30日期间,于中国五家地区哨点医院开展,系统收集了百日咳PCR确诊病例的流行病学、临床及免疫接种信息。


该研究纳入来自中国五地哨点医院共14,874例PCR确诊的百日咳病例,发病高峰集中在4–7月,4–10岁儿童占多数(74.3%)。近半数病例有疫苗接种史,其中90.7%为完全接种,突破性感染多见于7月龄以上儿童。828例住院病例中71.7%伴并发症,重症率和死亡率分别为5.7%和0.24%。家庭聚集性感染明显,64%的家庭成员PCR阳性。从1921份样本中成功分离394株百日咳杆菌,99.7%对阿奇霉素耐药,部分对SMZ-TMP敏感,对左氧氟沙星等四种抗生素普遍敏感。分离株主要为ptxP3/AgST4型、ST-2型、MT28-上海克隆株,PRN缺失率达23.4%,提示该流行株具有明显耐药性及抗原漂移特征。


百日咳病例的流行病学特征


2024年1月1日至9月30日,中国五家哨点医院共报告14,874例PCR确诊的百日咳病例,主要集中在华东地区的上海(9562例)和安徽(4139例),呈现春季上升、4–7月高峰的季节性趋势;而华南及内蒙古地区病例相对较少,且流行峰值时间不同。


图1. 各省/市PCR确诊病例分布,分离株数量属于MT28克隆型、prn缺陷型和ptxP3型


患者中4–10岁儿童占比最高(74.3%),其中5–7岁患儿最多(占46.0%)。各地病例的年龄分布存在统计学差异。婴儿病例比例在海南最高(44.4%),上海最低(4.4%);


图2. 按日历月以及按年龄划分的PCR确诊病例分布


学龄儿童和青少年病例则在内蒙古和上海比例较高。整体流行病学特征提示本轮百日咳疫情主要集中于学龄期儿童,且区域间在年龄分布和季节性流行方面存在显著差异。


百日咳个案的疫苗接种情况


在报告的百日咳病例中,有48.7%(7238例)提供了疫苗接种信息。其中90.7%(6563例)为完全接种;部分接种者占3.4%,未接种者占5.9%。突破性 感染主要出现在7月龄及以上的已完全接种儿童中。5–6月龄婴儿中约6.0%完成接种,7–35月龄儿童中完全接种率为70.7%–95%,3–17岁儿童中几乎全部(近99%)已完全接种。


百日咳病例的临床特点


疾病严重程度与年龄密切相关,呈现出随年龄增长而减轻的趋势。住院病例中0–2月龄婴儿病情最重。住院病例中71.7%存在并发症,以肺炎最常见(69.7%)。多数住院患者已在入院前接受抗菌治疗,入院后多使用TMP-SMX(70.9%)和头孢哌酮/舒巴坦(56.0%)等药物。临床表现中典型阵发性咳嗽(91.4%)最常见,婴幼儿更易出现发绀(20.9%)和呼吸暂停(9.1%)。血液检查显示26.1%存在白细胞增多,其中0–2月龄组最明显(37.9%),重度增高者以婴儿为主。


重症百日咳病例的临床特点


共有47例0–4岁重症百日咳患儿进入ICU治疗,其中68.1%为0–2月龄婴儿,93.6%未接种疫苗。临床表现以阵发性咳嗽(97.9%)、发绀(76.6%)、咳后呕吐和发热(均为44.7%)为主。63.8%存在白细胞增多,93.6%合并肺炎,12.8%并发脑病或因高白细胞引发肺动脉高压。42.6%需呼吸机支持,8.5%接受换血治疗。住院前多数患儿使用头孢或大环内酯类抗生素,入院后仍以大环内酯、头孢哌酮/舒巴坦、TMP-SMX为主。


抗菌药物敏感试验


在1921份鼻咽拭子中共分离出394株百日咳鲍特菌(B. pertussis),其中309株来自PCR阳性患儿,85株来自其家庭成员。安徽(186株)和上海(166株)为主要来源,除1株外,其余393株对阿奇霉素表现出高水平耐药(MIC 16–256 μg/ml),耐药机制均为23S rRNA基因A2047G突变(等位基因13)。所有菌株对TMP-SMX敏感,但是观察到52·0%菌株对TMP-SMX中介敏感。 所有菌株对左氧氟沙星、多西环素、头孢他啶和头孢哌酮/舒巴坦敏感。未检测到其他抗药基因,也未发现FhaB缺失菌株。


疫苗抗原基因分析


394株百日咳鲍特菌中,99.7%为BPagST4型。prn全基因序列分析显示,23.4%(92株)为PRN缺失株,其中绝大多数(95.7%)因IS481插入导致;主要插入位点为239–240位点。PRN缺失菌株在不同地区的检出率不一,内蒙古最高(66.7%),海南未检出。prn-150为主要等位基因,占比75.4%。



图3. 基于SNP的2018-2024年百日咳分离株系统发育分析


百日咳分离株基因分型及系统发育分析


所有菌株均属于MLST分型的ST-2型,其中99.7%携带bscI(BP2249)等位基因2。三种MLVA型中,99.5%(392/394)为携带ptxP3的MT28型。SNP系统发育分析显示菌株分为ptxP1和ptxP3两个分支,其中2024年几乎全部为ptxP3分支中的“MT28-上海克隆”(99.5%,392/394),其特征为ptxP3、AgST4、23S rRNA-13突变(耐红霉素)以及prn-150。该克隆进一步分为六个亚群(I至VI),每个亚群均具有特异性SNP,其中III亚群由prn缺失株构成,缺失原因为IS481插入prn-150位点。


百日咳无性系在家庭中的传播


在630个有PCR确诊百日咳患儿的家庭中,共收集了908份家庭接触者的鼻咽拭子样本,患者及至少一名家庭成员均检测出百日咳杆菌阳性。家庭传播阳性率在各地差异明显,安徽和福建分别达78.2%与77.8%。在50对来自同一家族的菌株中,有86%(43对)属于相同分支,SNP差异在0–7之间,其中32对完全相同(0 SNP);其余14%(7对)来自不同分支,SNP差异为5–11个,提示大部分家庭传播源为同一菌株。


综上所述,该研究共分析了2024年百日咳疫情中630个确诊患儿家庭的接触者情况,发现64%的家庭中至少有一位成员也感染了百日咳杆菌,提示家庭内传播非常普遍。通过对50对家庭内分离菌株进行全基因组测序,发现其中86%的菌株对为相同克隆、SNP差异极小(0–7个),进一步支持了百日咳在家庭中由同一源菌株传播的证据。这表明家庭是百日咳传播和持续流行的关键场所,防控措施应特别重视对家庭密切接触者的早期筛查与干预。


原文链接

https://doi.org/10.1016/j.lanwpc.2025.101628


本文内容来源自订阅号“生命科学前沿”,原链接:复旦大学张文宏、陈明亮、曾玫联合团队最新研究发表柳叶刀子刊!导致2024年中国百日咳大规模暴发的主要原因


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本文完

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